Наськолько я знаю stk500 программатор это серьезная плата а не простенький Usb шнурик ?

у каждого устройства (будь оно USB-шным, PCI-ным или еще каким) есть 2 основных идентификатора Vendor ID и Product ID (есть еще Product version ID и еще другие, но они второстепенные). так вот однажды установленный драйвер будет цепляться ко всем устройствам с такими ID.

ну и кроме того програматор- это обычно пара микросхем и куча панелек, в вашем "шнурке" наверняка тоже есть пара тех-же микросхем.

Насколько я знаю avrdude сам ничего не определяет. Если он считает USB шнур программатором stk500, значит так ему сказано настройками среды разработки или графической оболочки (смотри конфигурационный файл, makefile и т.д. и т.п.).

В конце концов avrdude это программа с чудным, интуитивно понятным консольным интерфейсом Всегда можно самому составить нужную команду

из avrdude.conf
programmer
id = "avrisp";
desc = "Atmel AVR ISP";
type = stk500;
;
Это вовсе не серьезная плата, в avrprog из atmel studio мой avr910 protoss так определяется