Всем доброго утра/дня/вечера/ночи! Сразу скажу, что вопросов будет много.
И так, поехали.

1. На этом сайте есть схема программатора. У меня такой вопрос: возможно ли этим программатором стереть старую прошивку, и записать новую?

2. Как передать через мобильный какое-то число? Тоесть есть два телефона, к каждому подключено по атмеге8, одна передает ряд чисел, другая принимает и обрабатывает. С обработкой проблем нет, как передать ряд чисел (например 1,5,3,9,8..., числа состоят только с одной цифры, ряд состоит из 10 чисел).

Далее будет.

1)Разумеется

стереть прошивку и записать конечно можно

2) Передача чисел удобна через канал GPRS. Это можно сделать через программы ICQ, либо, с несколько бОльшей задержкой по времени передачи, написав страницу со скриптом и разместив её в интернете.
Если стоимость связи не играет решающего значения, лучше всего воспользоваться SMS.

Белый Волк, я неточно выразился.
Может кто видел фильм "Шакал"? Там в конце фильма Шакал наводит пушку на первую леди, наведение ведется через мобильный. Приблизительно то же самое надо и мне. Только там два канала (влево/вправо, вверх/вниз), а мне надо 8. Хочу сделать управление для авиамодели.

З.И. Расскажу все как есть.
Задумка такая: у руках пульт, каждые пару миллисекунду атмега на пульту смотрит на какой позиции джойстик, переключатели и остальное управление. Все это передает по мобильному на бортовую мобилу. На борту сигнал с мобильного "читается" и обрабатывается.
(Добавление)
По первому вопросу всем спасибо.

Можете использовать звуковой канал и написать собственный протокол передачи данных. Например: СТАРТОВАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ - ДАННЫЕ - КОНТРОЛЬНАЯ СУММА. Только обновлять данные таким способом каждые «пару миллисекунду» не получиться. Во всяком случае при полосе пропускания звукового канала 3кГц, ближайшая стандартная скорость передачи 2400 бод. Следовательно один бинарный символ передаётся за 416,6мкС. На практике, полезных данных будет передаваться, хорошо, если половина от длинны всего пакета. Вот и прикиньте, за сколько времени можно передать необходимые данные из пункта А в пункт Б. Можно, правда расширить полосу пропускания канала связи. Тогда больше подойдут не сотовые телефоны, а доработанные портативные радиостанции.

Группа Инженеров, большое спасибо за подробный ответ.

3. Такой вопрос: надо посчитать сколько оборотов сделал мотор. хочу использовать такой же принцип как и у скроллинга миши. Помогите, пожайлуста, кодом на С.

4. Делаю радіоуправление, надо приемник и передатчик с большим (1 км и больше) радиусом действия. У кого есть схема?

можно взять овтомобильную сигнализацию, и добавить УВЧ на брелок.